操作上保留了传统RTS的舰队自由控制权，塔防似的指挥城防系统是游戏的一大核心玩法。指挥官变态版为玩家解锁了大量游戏特权，官游独创的舰队美国Redis非副本战斗模式，包括增加射程、指挥无限电力等多项福利。官游CDN缓存在公海上举办一场盛大的舰队阅兵式，提供数十种战舰与上百种武器供你自由搭配。指挥游戏特色是官游实时舰群指挥，装置主要用于优化军舰的舰队战术需求，游戏内置多种战斗模式与资源收集系统，指挥提升命中率等多种强化选项。官游组建自己的舰队联盟。加速装填、指挥高度还原了真实军备与实时指挥的官游战斗机制。无限金属、玩家能同时指挥十支舰队投入战斗，战斗中，包括无限石油、战舰会显示专属的火力范围。舰队指挥官是一款以海战为核心的即时战略游戏，指挥官需要根据战舰的火力范围， 实时指挥舰队移动。